贵州科学院的前身为民国贵州省建设厅化验室，始建于1935年，历经多次更名、资源整合和隶属关系变动，1958年成立中国科学院贵州分院，1978年正式组建贵州科学院，是贵州省人民政府直属正厅级事业单位，2012年批准组建贵州省应用技术研究院，与贵州科学院实行两块牌子一个工作班子的管理体制。